Malagón se ubica en el sector noreste de la comarca de Montes Norte. Es la localidad de mayor extensión de la comarca, con 364 km2, y una de las más importantes de la provincia, en la que habitan 8.033 personas según el censo de 2001. Dista 23 km de la capital.
Situada a 634 m de altitud sobre el nivel del mar, la villa de Malagón se encuentra rodeada de una gran llanura que se interrumpe al noroeste con la Sierra de Malagón. Bañan su término los ríos Bañuelos y Becea y el arroyo del Tamujo, todos ellos tributarios del Guadiana. Hay que mencionar la presencia al pie de la mencionada sierra de tres lagunas de origen volcánico: la Nava Grande, la Nava de Enmedio y la Nava Pequeña o Chica.
Las aldeas de Malagón son El Cristo del Espíritu Santo, La Fuencaliente, Las Peralosas, El Sotillo, Los Quiles, Valdehierro, Piedralá y el anejo Las Povedillas.
Las vías de acceso son:
- La carretera nacional N-401 desde Ciudad Real, Toledo y Fuente el Fresno, y
- La carretera CR-4114 desde Porzuna y Daimiel.
